2022-02-18 09:25:58

研究人员确定了可能会逃避细胞免疫反应的 SARS-CoV-2 变体

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https://phys.org/news/2022-02-sars-cov-variants-potential-cellular-immune.html



世界地图表明存在携带 A*74 家族等位基因的群体样本及这些家族具有避开突变的分离物（绿色圆圈）。图片来源：Foix A 等人，2022，PLOS 计算生物学，CC-BY 4.0 (creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

许多现有的 SARS-CoV-2 毒株及未来可能会出现的其他变体，有部分-可能会逃避免疫系统中的细胞毒性 T 细胞反应。这是由西班牙卡洛斯三世健康研究所的 Antonio Martín-Galiano 及其同事于 2 月 10 日，在 PLOS 计算生物学上发表的一项新建模研究的结论。
 
人类的 T 细胞反应是由 HLA 分子遗传编码的——这意味着不同的个体具有不同的 HLA，可根据病原体的不同部位或“表位”来识别入侵的病原体。由于人群中有数千种不同的 HLA 分子及任何给定病毒中的数千种可能的表位，因此对每个人类 HLA 等位基因对每种病毒变体的免疫反应的实验评估是不可行的。但是，计算方法可以促进这项任务。
 
在这项新研究中，研究人员首先确定了来自中国武汉的 SARS-CoV-2 原始毒株的全套表位。该团队发现了1,222 组与主要 HLA 亚型相关的 SARS-CoV-2 表位，覆盖了约 90% 的人口；基于这 1,222 组表位，每 10 人中至少有 9 人可以对 COVID-19 发起 T 细胞反应。
 
然后，研究人员通过计算分析了，国家生物技术信息中心 (NCBI) 集中研究数据库里来自世界各地的 118,000 种不同的 SARS-CoV-2 分离株，是否在这些表位中发生突变。他们表明，47% 的表位在至少一种的现有分离物中发生了突变。在某种情况下，现有分离株在多个表位区域发生突变，但累积突变从未影响到任何给定 HLA 等位基因类型超过 15% 的表位。当研究小组分析易感等位基因及其各自逃逸分离物的地理起源时，研究小组发现它们在一些地理区域共存——包括撒哈拉以南非洲以及东亚和东南亚——这表明细胞毒性 T 细胞存在潜在的遗传压力。
 
作者说：“独立分离株里积累到的变化仍然太低，不足以威胁到全球人口。” “我们的方案已经确定了可能与特定人群相关的突变，并需要进行更深入的监测。”
 
然而，Martín-Galiano 指出，“未被注意到的 SARS-CoV-2 突变”可能在未来“威胁到人类亚群的细胞毒性 T 反应”。
 

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